Кафедра «Гистологии и патанатомии» была создана в 1993 году с открытием медицинского факультета под названием «Морфологических дисциплин» и заведовал кафедрой д.м.н., проф. Жапаров Б.Ж.
С 1995 по 1998гг. кафедрой заведовали к.м.н., доцент Джумабаев Ч.Ж. и к.м.н., доцент Ахунжанов Р.А. В 2001 году 20 октября приказом №217 была организована кафедра «Гистологии и патанатомии», заведующим 
кафедрой являлся д.м.н., профессор Жапаров Б.Ж.
С 2007 года по настоящее время кафедрой заведует д.м.н., профессор Шатманов С.Т.
Все эти годы на кафедре преподаются следующие предметы:
а) Гистология, цитология и эмбриология
б) Патологическая анатомия
в) Секционный курс
г) Патология
Качественный состав кафедры составляет: 1 профессор, д.м.н., 1 Отличник Здравоохранения КР, 4 старших преподавателей, 3 штатных преподавателей, 2 совместителей и 2 вспомогательных персоналов. Профессорско-преподавательский состав кафедры 2011г. Научная тема кафедры: «Морфофункциональное состояние эндокринных органов в условиях высокогорья». Данный момент под руководством профессора Шатманова С.Т. работают над кандидатскими темами соискатели Саттаров А.Э. и Жаныбек кызы Каныкей. Сотрудники кафедры участвовали зарубежных и местных научно-практических конференциях, симпозиумах (Орел РФ, 2006; Бухара 2008; Ярославль РФ, 2010). Сотрудниками кафедры были выпущены более 200 научных трудов. Из них: 12 учебно-методических пособия, 2 учебника, научные статьи. На кафедре функционируют 2 научно-студенческих кружка по гистологии и по патологической анатомии. Студенты самостоятельно под руководством преподавателей готовят микропрепараты, участвуют на вскрытиях, помогают при изготовлении макропрепаратов. Сотрудники кафедры периодически и своевременно повышают квалификацию как по специальностям, так и по педагогике высшей школы. Занятия проводятся на высоком уровне с применением современных инновационных технологий, так и традиционными методами.Заведующий кафедрой гистологии и патанатомии д.м.н., профессор Шатманов Суйнали Токтоназарович решением Президиума Российской Академии Естествознания избран членом-корреспондентом Российской Академии Естествознания (РАЕ) по секции «Медицинские науки» и приглашен для торжественного вручения диплома в Юбилейные международные научные мероприятия Российской Академии Естествознания (РАЕ) и Европейского научно-промышленного консорциума (ESIC), приуроченных к 20-летию РАЕ c 8 по 11 октября 2015 г. г.Сочи Шилтеме Шилтеме